Kaplica Wieczystej Adoracji
Po prawej stronie od wyjścia głównego z Bazyliki znajduje się Kaplica Wieczystej Adoracji. Została ona poświęcona w 2004 roku przez kard. Franciszka Macharskiego. Od tego czasu zaczęła się w niej całodzienna adoracja Najświętszego Sakramentu. Rok później – w przeddzień Święta Miłosierdzia, kiedy Jan Paweł II odchodził do Domu Ojca, rozpoczęła się adoracja Wieczysta Najświętszego Sakramentu. Ojciec Święty skierował list do pielgrzymów przybywających do Łagiewnik na to święto, w którym napisał:
Zbliża się Niedziela Miłosierdzia Bożego. Z tej okazji pragnę przekazać moje serdeczne pozdrowienia wszystkim, którzy będą się gromadzić w krakowskim Sanktuarium w Łagiewnikach, aby wielbić Boga za Jego przebaczającą miłość. Pragnę ponownie zawierzyć tej miłości Kościół i świat, wszystkich ludzi na całym okręgu ziemi, a także siebie samego w mojej słabości. Cieszę się, że w tę niedzielę rozpocznie się w Sanktuarium wieczysta adoracja Najświętszego Sakramentu. Nic tak, jak eucharystyczna obecność Pana, nie uobecnia dzieła miłosierdzia, jakie dokonało się przez Krzyż i Zmartwychwstanie. Niech zatem ta obecność będzie dla wszystkich pielgrzymów źródłem mocy i nadziei. Wszystkim czcicielom Bożego Miłosierdzia z serca błogosławię: W imię Ojca i Syna, i Ducha Świętego.
Kaplica, która swoim wyglądem przypomina rotundę, wybudowana jest według projektu prof. Witolda Cęckiewicza. Zdobią ją witraże z elementami kwiatowymi. W centralnym miejscu ustawiony jest ołtarz w kształcie ognia, w płomieniach którego umieszczono monstrancję. Płonie tu wieczysta lampka z ogniem Miłosierdzia, który zapalił Ojciec Święty Jan Paweł II 16 grudnia 2003 roku na znak rozchodzącego się z tego miejsca na cały świat orędzia o Bożym miłosierdziu. Od 11 kwietnia 2021 roku jest dostępna całodobowa transmisja na żywo z Kaplicy Wieczystej Adoracji na stronie www.misericordia.eu.